Из Бургундской династии.

Родился 8.09.1209. Старший сын Афонсу II и Урраки, дочери Альфонсо VIII Кастильского

К моменту его вступления на трон в 1233 Португалия была вовлечена в сложный дипломатический конфликт с римско-католической церковью. Его отец, Афонсу II был отлучён от церкви Папой Гонорием III за попытки снизить её влияние в стране. Между Саншу II и Папой было подписано соглашение, но король впоследствии мало уделял внимания его исполнению.

Его приоритетом была Реконкиста, отвоевание юга Пиренейского п-ва у мавров. Начиная с 1236, Саншу II захватил несколько городов в Алгарве и Алентежу, укрепляя португальские позиции в регионе.

Саншу II был способным командующим, но в столь же важных для государства административных вопросах показал себя менее компетентным. Пока всё его внимание было сосредоточено на военных кампаниях, возникла почва для внутренних разногласий. Знать была недовольна курсом короля, и готовился заговор. Более того, средний класс торговцев часто ссорился с духовенством, что король оставлял без вмешательства.

В результате архиепископ Порто направил Папе о бедственном положении, и, поскольку церковь в XIII веке обладала огромным влиянием, Папа издал буллу, приказав португальцам избрать себе нового короля, объявив Саншу еретиком.

В 1246 мятежная знать пригласила на престол Афонсу, графа Булонского, младшего брата Саншу, жившего во Франции. Афонсу немедленно отказался от всех своих французских владений и выступил в Португалию. Саншу II в 1247 бежал в Толедо, где и умер 4.11.1248.