Из Бургундской династии.

Родился 5.05.1210. Младший сын Афонсу II и Урраки, дочери Альфонсо VIII Кастильского

Поскольку Афонсу был вторым сыном, он не воспитывался как наследник престола, и никто не ожидал его восхождения на трон, который был предназначен его старшему брату Саншу. Жил Афонсу в основном во Франции, где в 1238 женился на богатой наследнице Матильде, и стал таким образом графом Булонским.

В 1246 конфликт между церковью и его старшим братом стал невыносим, и Папа Иннокентий IV приказал сместить Саншу II, заменив его графом Булонским. Афонсу, конечно, не мог противиться велению Папы и направился в Португалию. Поскольку Саншу не был популярным монархом, выполнить приказ не составляло большого труда. Саншу был изгнан в Кастилию, и Афонсу III в 1247 стал королём. Для вступления на престол ему пришлось отречься от титула графа Булонского и развестись с Матильдой.

Решив не повторять ошибок брата, Афонсу уделял пристальное внимание состоянию дел, мнениям и жалобам средних торговцев и мелких землевладельцев. В 1254 в городе Лейрии Афонсу III собирает первые кортесы, королевскую генеральную ассамблею, куда входят знать, среднее купечество и представители всех муниципалитетов.

Он также издаёт свод законов, ограничивающих возможность притеснений высшей знатью менее привилегированного населения. Вошедший в историю как выдающийся администратор, Афонсу III основал несколько городов и даровал хартии городов многим существовавшим поселениям, а также реорганизовал аппарат государственного управления.

Утвердившись на троне, Афонсу III продолжил войну с мусульманскими сообществами, всё ещё буйно разраставшимися на юге. В 1261 Алгарве стала частью королевства, вслед за захватом Фару, и Португалия стала, таким образом, первым иберийским королевством, завершившим Реконкисту. С тех пор португальские монархи титулуют себя королями Португалии и Алгарве.

Завершив успешно войну с маврами, Афонсу III должен был ещё разрешить трудную политическую ситуацию на границе с Кастилией. Соседнее королевство рассматривало Алгарве как зону своих интересов, а не часть Португалии. Эта ситуация привела к серии войн между странами. В конечном итоге в 1267 в Бадахосе было подписано соглашение о южных границах между Кастилией и Португалией, определяемых рекой Гвадиана.

Он умер 16.02.1279. От брака с Беатрис (1242-1303), внебрачной дочерью Альфонсо X Кастильского, было 8 детей: Бранка (1259-1321), Фернанду (1260-1262), Диниш (1261-1325), Афонсу (1263-1312), Мария (1264-1284), Санша (1264-1279), Констанса (1266-1271) и Висенте (1268-1271).

Диниш, старший из сыновей, оставшихся после смерти короля, унаследовал королевский престол. Другой его сын, Афонсу женился на Виоланте (1265-1296), дочери Альфонсо X Кастильского.