Из династии Браганса.

Родился 26.04.1648. Второй сын короля Португалии Жуана IV и Луизы де Гусман.

Когда стало понятно, что из его старшего брата, Афонсу VI, получился негодный правитель, королева-мать стала готовить Педру к трону. Со временем вокруг него сложилась сильная партия, недовольная беспутным Афонсу и пользовавшаяся поддержкой народа. Вскоре к ним примкнула и королева Мария-Франциска, рассорившаяся с мужем.

1.10.1667 Педру со своими сторонниками захватил дворец и потребовал, чтобы Афонсу удалил от управления своих фаворитов. Народ, окруживший дворец, требовал того же. Король был вынужден согласиться. Афонсу фактически находился под домашним арестом во дворце в Синтре. Государственными делами занимался Педру, но он не принимал короны до смерти брата.

В 1668 он взял в жены Марию-Франциску Савойскую-Немурскую (1646-1683), супругу брата, которая добилась развода с мужем. От этого брака была только одна дочь Исабель (1669-1690).

Педру закончил выгодным миром 27-летнюю войну с Испанией, которая 13.02.1668 признала независимость Португалии. В 1669 Голландия признала Бразилию португальской колонией в обмен на уступку ей колоний на Цейлоне. Вскоре в Бразилии были открыты золотые копи, принесшие Педру огромные богатства.

Став королём после смерти брата в 1683, Педру постепенно укреплял свою власть и всё реже созывал кортесы. По примеру Луи XIV Французского, он установил в Португалии абсолютизм и в 1697 окончательно распустил кортесы.

После смерти Марии Немурской в 1687 Педру женился во второй раз на Марии-Софии (1666-1699), дочери курфюрста Филиппа Вильгельма Пфальц-Нейбургского.

После смерти Карла II Испанского, не оставившего наследника, Луи XIV Французский в 1700 посадил на испанский престол своего внука, Филиппа V.

В Войне за испанское наследство Португалия присоединилась к союзу, сформированному для изгнания Бурбонов из Испании.

В 1703 в разгар Войны за испанское наследство, Педру подписал знаменитый Метуэнский договор с Англией, по которому последняя получала право ввозить беспошлинно в Португалию свои шерстяные изделия, что ранее не позволялось никаким государствам. В обмен на это Португалия получала право ввозить в Англию свои вина на льготных условиях.

Предоставленные Англии преимущества позволили ей в короткий срок овладеть почти всей торговлей Португалии и вместе с тем подавить развитие местной промышленности, что обусловило экономическую, а затем и политическую зависимость Португалии от Англии, продлившуюся вплоть до мировых войн, несмотря на то, что в 1836 году Метуэнский договор был формально отменен.

Англо-португальские войска дважды вступали в Мадрид, но им не удалось ни удержать этот город, ни воодушевить испанцев на борьбу с французами. В соответствии с Утрехтским миром (11.04.1713) Бурбоны остались на испанском престоле, а португальцы укрепили союз с Англией и Австрией.

Педру II умер 9.12.1706 и ему наследовал старший сын от второго брака Жуан (1689-1750). От этого брака осталось ещё трое сыновей: Франциск (1691-1742), Антониу Франсишку (1695-1757) и Мануэль (1697-1766), а также дочь Франсишка Жусепа (1699-1756).