Из династии Церингенов.

Родился в 1249. Сын Германа VI, маркграфа Бадена, и Гертруды Бабенберг, герцогини Австрии и Штирии и племянницы последнего австрийского герцога из династии Бабенбергов Фридриха II Воинственного.

Родившись незадолго до смерти своего отца, он воспитывался в Баварии вместе с Конрадином, сыном императора Священной Римской империи Конрада IV.

В 1250 скончался император Фридрих II, и в Германии на несколько десятилетий воцарилась анархия. Этим воспользовались соседние с Австрией государства — Бавария, Богемия и Венгрия, которые попытались захватить герцогство. Годовалый Фридрих Баденский практически не имел опоры. В 1251 австрийское дворянство выступило в поддержку чешского принца Оттокара Пржемысла, который занял Вену и был провозглашён герцогом Австрии и Штирии. В следующем году он женился на Маргарите Бабенберг, сестре последнего герцога из рода Бабенбергов. Опираясь на мощную чешскую армию и поддержку австрийской аристократии, Отакар II Пржемысл сверг власть Фридриха Баденского.

Фридрих Баденский какое-то время жил при дворе своего родственника, герцога Каринтии Ульриха III, а позднее вернулся в Баварию, где примкнул к армии Конрадина, направившейся в 1267 в Италию отвоёвывать Сицилийское королевство. Это вторжение, однако, закончилось провалом. 8.09.1268 Фридрих Баденский вместе с Конрадином был пленён и передан в руки Карла I Анжуйского. 29.10.1268 оба пленника были публично обезглавлены в Неаполе.

Фридрих Баденский не был женат и детей не имел. Маркграфство Баденское после его смерти перешло к его дяде, Рудольфу I.